Excitačno-emisné matice exozómov izolovaných z moču a krvi
| Authors: |
Daniela Džubinská 1
Milan Zvarík 1
Martina Velísková 1
Iveta Waczulíková 1
1 Fakulta matematiky, fyziky a informatiky Univerzity Komenského v Bratislave, Bratislava, Slovenská republika |
|---|---|
| Year: | 2021 |
| Section: | Biophysics, physics, mathematical modeling, biostatistics |
| Abstract No.: | 2218 |
| ISBN: | ISBN 978-80-972360-7-6 |
Exozómy, ako nástroj medzibunkovej komunikácie, sú prítomné vo všetkých telesných tekutinách [1]. Ich obsah nesie molekulárne podpisy podobné bunkám, z ktorých boli sekretované, a preto sa považujú za vhodný zdroj potenciálnych biomarkerov [2]. Keďže mnohé z bioaktívnych molekúl vykazujú endogénnu fluorescenciu, rozdiely vo fluorescenčných charakteristických exozómov by sa mohli použiť v diagnostike rôznych ochorení.
Predložená práca sa zaoberá zmenami fluorescenčných charakteristík exozómov izolovaných z moču a krvi pacientov s rakovinou močového mechúra a pacientov s benígnou hematúriou. Exozómy boli izolované pomocou ultrafiltrácie a vylučovacej chromatografie podľa veľkosti a následne bola zmeraná ich celková fluorescencia pri vlnových dĺžkach excitácie a emisie v rozmedzí 200 – 800 nm. Získané spektrá boli vizualizované excitačno-emisnými maticami, na základe ktorých sme identifikovali oblasti s intenzívnou fluorescenciou. Aplikovaním jednorozmerných analýz na vybrané oblasti fluorescencie exozómov sme určili také, ktoré by s dostatočnou spoľahlivosťou odlíšili pacientov s rakovinou močového mechúra od pacientov s hematúriou a mohli tak byť použité pre vytvorenie predikčného modelu s potenciálnym využitím v oblasti klinickej diagnostiky.
Kľúčové slová: excitačno-emisná matica, exozóm, rakovina močového mechúra
[2] Mathivanan, Fahner, Reid, Simpson, 2012. ExoCarta 2012: database of exosomal proteins, RNA and lipids. Nucleic Acids Research. 40(DI). D1241–D1244pp. doi:10.1093/nar/gkr828.