Objasnenie funkcie proteínu Dbl2 v udržiavaní stability nukleozómov v bunkách S. pombe
| Authors: |
Alexandra Piteľová 1
Ivana Mišová 1
Jaroslav Budiš 2,3,4
Juraj Gazdarica 5,3,4
Tatiana Sedláčková 2,3
Tomáš Szemes 5,2,3,4
Silvia Bágeľová Poláková 1
1 Centrum biovied SAV, Ústav biochémie a genetiky živočíchov, Bratislava, Slovenská republika 2 Vedecký park Univerzity Komenského, Bratislava, Slovenská republika 3 Geneton Ltd., Bratislava, Slovenská republika 4 Centrum vedecko-technických informácií SR, Bratislava, Slovenská republika 5 Univerzita Komenského v Bratislave, Prírodovedecká fakulta, Katedra molekulárnej biológie, Bratislava, Slovenská republika |
|---|---|
| Year: | 2021 |
| Section: | Molecular biology and genetics |
| Abstract No.: | 2102 |
| ISBN: | ISBN 978-80-972360-7-6 |
Súčasne prebiehajúce projekty súvisiace s novoobjaveným proteínom Dbl2 v bunkách kvasinky Schizosaccharomyces pombe, sú zamerané najmä na objasnenie jeho funkcie. Z predchádzajúcich experimentov je známe, že Dbl2 sa podieľa najmä̈ na správnom priebehu mitózy, meiózy a lokalizácii helikázy Fbh1, ktorá je dôležitá v procese homologickej rekombinácie, kde odstraňuje proteín Rad51 z Rad51-ssDNA filamentu [1]. V priebehu analýzy proteín-proteínových interakcií prostredníctvom kvasinkového dvojhybridného systému bol v prípade Dbl2 pozorovaný zaujímavý jav, a to, že fúzia génu dbl2 a GAL4 DNA-viažucej domény spúšťa expresiu reportérového génu. Tento objav naznačoval funkciu proteínu Dbl2 v génovej expresii.
V bunkách S. pombe je represia génovej expresie zabezpečovaná viacerými spôsobmi. Naším hlavným cieľom v tejto práci bude zapojiť proteín Dbl2 do jednej z dráh vedúcich k utlmovaniu génovej expresie a priniesť nové informácie o mechanizme, akým sa môže proteín homologickej rekombinácie podieľať aj na systematickej regulácii génovej expresie.
Výsledky našich experimentov ukázali, že delécia génu dbl2 je v bunkách S. pombe sprevádzaná zmenou v expresii mnohých lokusov. Expresia väčšiny týchto lokusov je súčasne regulovaná aj proteínom Hip1, ktorý je jednou z podjednotiek histón šaperónového komplexu HIRA. V neprítomnosti funkčného variantu proteínu Hip1 dochádza k narušeniu normálnej hladiny expresie centromerických oblastí [2], pričom súčasná delécia génov dbl2 a hip1 dokáže prinavrátiť normálny stav, čo naznačuje ich opozitnú funkciu v procese génovej represie. Navyše sme ukázali, že delécia génu dbl2 ovplyvňuje stabilitu -2, -1 a +1 nukleozómu v okolí začiatkov transkripcie, čo naznačuje zapojenie proteínu Dbl2 v procese destabilizácie nukleozómov a celkovej zmeny architektúry chromatínu v bunkách S. pombe.
[2] Yamane K., Mizuguchi T., Cui B., et. al. (2011) Mol. Cell 41(1), p. 56–66.