Heterologická expresia a purifikácia neuropeptidu ITPL z Bombyx mori v Escherichia coli
Authors: |
Andrea Hubináková 1
Zdenko Levarski 2
Stanislava Bírová 1
Eva Struhárňanská 1
Stanislav Stuchlík 1
Ján Turňa 1,2
1 Univerzita Komenského v Bratislave, Prírodovedecká fakulta, Katedra molekulárnej biológie, Mlynská dolina, Ilkovičova 6, 842 15 Bratislava, Slovenská republika 2 Univerzita Komenského v Bratislave, Vedecký park, Ilkovičova 8, 842 16 Bratislava, Slovenská republika |
---|---|
Year: | 2017 |
Section: | Open section for students |
Abstract No.: | 1692 |
ISBN: | 978-80-972360-1-4 |
Iónový transportný peptid (ITP) a jeho alternatívna zostrihová varianta, proteín podobný iónovému transportnému peptidu (ITPL) sú hmyzie neuropeptidy. Tieto peptidy boli identifikované ako modulátory homeostatických mechanizmov u hmyzu v prednej časti zadného čreva (ileum). Biologicky aktívny ITPL obsahuje 6 cysteínov, ktoré vytvárajú tri vysoko konzervované intramolekulové disulfidové väzby, podobne ako u ITP [1-2]. Štúdie zamerané na funkciu ITPL u hmyzu nie sú až také rozsiahle a práve z tohto dôvodu sme sa zamerali na produkciu tohto proteínu v Escherichia coli.
Počet disulfidových väzieb a veľkosť ITPL (9 kDa) proteínu vytvára limitácie pri produkcii správne poskladaného proteínu v cytoplazme E. coli. Aj napriek všetkým výhodám produkcie proteínov v E. coli, cytoplazma divokého kmeňa neposkytuje vhodné prostredie na tvorbu disulfidových väzieb. To môže viesť k vytváraniu nerozpustných agregátov- inklúznych telesiok. Na zníženie alebo zamedzenie tvorby inklúznych teliesok sa používajú viaceré stratégie napr. použitie jedného alebo kombináciu viacerých fúznych partnerov, optimalizácia kultivačných podmienok, zloženie média a teplota pri heterologickej expresii, a iné [3-4].
Cieľom tohto projektu je nadprodukcia fúzneho proteínu ITPL (23 kDa) v solubilnej forme a jeho purifikácia na následné využitie pri funkčných štúdiách v hmyzom modelovom organizme, Bombyx mori.
[2] Nagai C., Mabashi-Asazuma H., Nagasawa H., et al. (2014) J. Biol. Chem 289(46), p. 32166.
[3] Levarski Z., Šoltýsová A., Krahulec J., et al. (2014) Protein Expres. Purif. 100, p. 40.
[4] Ke N., Berkmen M. (2014) Curr. Protoc. Mol. Biol. 108(16), p. 1.